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Die Umstellung der letzten n-Wagenzüge der Mainfrankenbahn, die ebenfalls für Dezember 2013 geplant war, konnte zunächst auch nicht umgesetzt werden, da ein Teil der 425/426 für Ersatzverkehre der E-Netze Werdenfels und Rosenheim noch benötigt wurden. Nach Auflösung des Würzburger n-Wagen-Bestandes im Dezember 2014 gelangten weitere 425 nach Würzburg, die nun die Leistungen der Mainfrankenbahn übernommen haben.
Auch im Jahre 2019 werden noch einzelne Leistungen der Mainfrankenbahn sowie der RB-Verkehr zwischen Würzburg und Lauda erbracht. Im Dezember 2020 wurde die Verbindung Würzburg - Treuchtlingen komplett von 440 auf 425 umgestellt.