Ebene	+1:	Gleise und Bahnsteige der DB.
	Ebene	0:	Bahnhofsvorhalle, Verkehrsflächen und Straßenbahn
	Ebene	-1:	Fußgänger-Verteilergeschoß
	Ebene	-2:	U-Bahnlinien 2 / 3 / 21
	Ebene	-3:	U-Bahnlinien 1 / 11

Alle Ebenen von 0 bis -3 sind mit Fest- und Fahrtreppen sowie Aufzügen verbunden. Das Fußgängergeschoß öffnet sich auch zum Stadtgraben und zum Platz vor dem "Viktoria"-Haus. Zahlreiche Kioske, Räume für die Stadtmission und Stadtpräsentation, eine Kundenzentrale der VAG, ein Unterwerk und mehrere Betriebsräume befinden sich in diesem Fußgängergeschoß.

Seit Januar 1978 fahren die Züge der U1 von Langwasser in Richtung Fürth den Bahnhof Hauptbahnhof an und seit Januar 1984 auf diesen Gleisen der U1 auch die Züge der U2 als U21 aus Richtung Schweinau/Röthenbach (U 2-Süd). Seit 24. September 1988 fährt die U2 ab Plärrer auf eigener Trasse entlang des Frauentorgrabens zum Hauptbahnhof als Endpunkt des ersten Streckenabschnittes der U2-Nord, die inzwischen über Rathenauplatz, Schoppershof und Ziegelstein bis zum Flughafen verlängert und fertig gestellt wurde.

Von dem 167 Meter langen Bauwerk für die U2 wurde der Westteil in einer Länge von 62 Metern bereits bei der U 1 mitgebaut. Dieser umfaßt die Bahnsteigröhren und einen Teil des Bahnsteiges der U 2 mit den Betriebsräumen sowie die Treppenanlagen für die Umsteigebeziehung. Der neu errichtete Ostteil ist 105 Meter lang. Er besteht aus dem überwiegenden Teil des Bahnsteigbereiches, dem gesamten östlichen Verteilergeschoß mit den dazugehörigen Aufgängen zur Straßenbahninsel und zur Post sowie einem Fußgängertunnel unter der Bahnhofstraße zur Gleißbühlstraße mit Treppenaufgang vor der Landeszentralbank. Ein galerieartiges Fußgängergeschoß verbindet die Westhalle mit der Osthalle dieser U-Bahnstation. Es ist gleichzeitig an den bestehenden Fußgängertunnel unter der Mittelinsel zum Königstor angeschlossen. An diesem Tunnel waren umfangreiche Abbruch- und Anpassungsmaßnahmen erforderlich. Dabei wurde auch der bestehende Treppenaufgang am Frauentorturm abgebrochen und durch eine fußgängerfreundliche Rampe ersetzt. Auf der Ostseite des Bahnhofsplatzes wurde der Aufgang zur DB angepaßt und gleichzeitig die anschließende Gehwegfläche bis zum Osteingang des Bahnhof-Gebäudes überdacht.

Für Behinderte und Mütter mit Kinderwagen ist in Bahnsteigmitte ein Aufzug vorhanden, der den Bahnsteig mit dem Verteilergeschoß und mit der Straßenbahninsel verbindet, am westlichen Bahnsteigende stellt ein weiterer Aufzug die Verbindung zum darunterliegenden Bahnsteig der U1 und zum darüberliegenden Fußgängerverteilergeschoß her. Fahrtreppen führen vom Bahnsteig zur U1 und an den beiden Bahnsteigenden zum Verteilergeschoß sowie an den Aufgängen zur Osthalle der DB, zur Straßenbahninsel und vor der Landeszentralbank vom Verteilergeschoß auf die Straßenebene.

Das Bahnhofsbauwerk und der Fußgängertunnel zur Gleißbühlstraße wurden in offener Bauweise mit Berliner Verbau errichtet. Im Bereich des Post-Hochhauses, das nur etwa 5 Meter entfernt steht und für die Umschließung des östlichen Bauwerksblockes wurde die Baugrube mit einer aufgelösten Bohrpfahlwand gesichert. Dieser Bahnhofsblock wurde in der sogenannten Deckelbauweise erstellt und diente gleichzeitig als Ziel- und Wendeschacht für die bergmännisch im Schildvortrieb aufgefahrene Tunnelstrecke Hauptbahnhof - Wöhrder Wiese. Er konnte erst endgültig hergestellt werden, nachdem die zweite Gleisröhre, die von hier aus vorgetrieben wurde, fertiggestellt war.